WastewaterSCAN によるウイルスの監視

最後の 365 日間、Stamen はグループ WastewaterSCAN と協力して、グループの一般向けの 最近の住居 を作成しました。 -米国のあるレベルで廃水処理植生から確保した詳細を視覚化する対面チャート.

たまたま COVID-19 や RSV などの他のウイルスに関する最も標準的なファイルをちらりと見たとしても、貢献者 (「 廃水監視と呼ばれるものに。 COVID-19 の検査が研究室ではなく自宅で行われることが増えるにつれて、研究室の評価から報告されたファイルは、手元にあるものが少なくなり、より信頼できるものではなくなりました。 しかし、下水道に住んでいる、または働いているすべてのアメリカ人は、その空間を提供する製品やプロバイダーが処理プラントを破壊する原因となり、病原体は、廃水処理植物で穏やかな廃水固形物によって過度の精度で検出される可能性があります. CDC の 国家廃水監視ガジェット は、1,200 を超える廃水処理植生からのファイルをめったに統合していませんが、廃水監視を使用して測定する重要な例です。 COVID-19 率。

WastewaterSCAN は、スタンフォード大学とエモリー大学の研究者のパートナーシップです。自治体の廃水処理植物と協力してさまざまな病原体を研究する業界および慈善団体と協力しています。 彼らのツールの手順は、義務付けられている場合にビデオを表示し、運動を行う部門である一般の人々がより簡単に使用できるようにすることです.いくつかのオプションで開発しようとしていた:

より多くの病原体のテストを開始することを計画しており、

それらは数十の治療用植生から上昇していました処理植物の多くに。

グループは、これまでに作成したいくつかの地図やチャートをまとめて添付していました。 Bay Notify で植生を脇に置くために効果的に機能しますが、彼らは、ユーザーを欺瞞的なコンボや比較から遠ざける可能性のある、より困難なものが必要であることを知っていました。アマチュアユーザーも同様です。

確かに、特定の廃水処理プラントが並ぶ地域の下水道のグループの初期の地図の 1 つです.

確かに、ある下水道でのCOVID-19率を示すグループの最初のチャートの1つ時間とともに。 ここで、真に一般的なウイルスであるPMMoVによって正規化された、すべてのCOVID-19バリアントに一般的な2つの遺伝子に出くわしました.

この作業における私たちの最初の焦点レベルは、精度でした。 グループ内の研究者に正しい傾向線とヒートマップ チャートを提供していること、および詳細を正確に表していることを確認したかったのです。 ここから、ツールをチャートビルダーに昇格させるさまざまな側面を含めることにより、ユーザーが独自の航空プレゼンテーションとエクスペリエンスのために分析をカスタマイズおよびエクスポートできるようにする追加の必要事項に対処しました。生ファイル、エラーバー、および場合によっては色の指定. このような課題に関する問題のかなりの量は、集計 を伴います。 視覚化の複数のオプション これらのオプションをキュレートし、解決するために利害関係者に対処するチャンスごとに、チャンスごとに、またチャンスごとに、どの代替選択肢を脇に置くことができるか。 弊社の発見により、ツールの詳細と特定の使用状況が判明した時点でプロセス、ワイヤーフレームとプロトタイプでさまざまなアプローチを試し、最終的に詳細を伝達するための視覚的な種類の正しい組み合わせに到達しました。

オン集約 等式の側面として、折れ線グラフとヒートマップを 1 つの精査に結合し、チャート ビルダーと名付けました。 ロード チャートは、特徴を明確に発見し、病原体の段階を経時的に比較する計画を明らかにします。一方、ヒートマップは、病原体が以前に検出されたかどうか、または検出されなくなったかどうかを完全に示します。 チャート ビルダーの使用は、チャートの形を取り、監視する必要がある場所と病原体、ファイル内の精査にかかる時間、および一連の異なる代替選択肢です。 結果として、このファイルを 1 回の精査でいくつかのオプションで視覚化することができますが、以前は、このパフォーマンスは、ユーザーがオプションの比較を保持する必要がある複数のページとチャートのいくつかのレベルに分散していました。

しかし、非常に多くの代替選択肢を提供することの避けられない手順: チャートビルダーは、圧倒的な純利益を得ることができます! そのようなピックがたくさんあり、そのうちのいくつかは、より高度なユーザーにとって貴重なものになる傾向があります. さらに、情報の切り分けを別の切り分けの情報と混合することが可能であるために、使いやすさと精度の考慮事項が脇に追いやられる可能性もあります。 キュレーション .

情報のいくつかのコンボは、チャンスごとに可能性があります欺瞞的である可能性があります。 リンクされた折れ線グラフに 2 つの異なる病原体を表示すると、一方の病原体の量が反対の病原体よりも増加していることが明らかになりますが、どちらの病原体を鎮静化するかは明らかになりません。チャンスごとに、チャンスごとに、またチャンスごとに、増加傾向にある可能性があります。または、その量が多数の病原体のさまざまな意味をむさぼり食う可能性があります。 そのため、キュレーションの面では、1 つのチャートで病原体を比較するスキルをユーザーに提供しなくなりました。 さらに、病原体間のバリエーションを強調するために、タブ付きの病原体セレクターを適用しました:

files.wastewaterscan.org の病原体セレクター.

これらのガードレールを脇に置いたとしても、1 つのチャート ビルダーを使用すると、病原体を比較することはさておき、並べ替えを行うと、疑わしいほど貴重な状況に陥る可能性があります.

たまたますべての COVID-説明のために、19 のバリアント (現時点では 8 つが追跡されています) がチャート上にあり、これらのバリアントすべてを 3 つの場所で同時に公開する必要があります。 24 行 のグラフ。 その多くの行を区別するのは複雑です。 ユーザーがそれらを区別するのをサポートするために、追加のインタラクティブな手がかりをむさぼり食う可能性もありますが (クルーズ中に近所のすべての路線を強調表示するなど)、これはユーザーがその相互作用をフェッチすることを前提としており (ほとんど無限の仮定です)、それは崩壊しますチャートのスクリーンショットを実行したり、印刷したり、携帯電話で精査したりしても、適度にフリートします。

その結果、もう 1 つの制限が追加されました。病原体 by スペース

または variant それにもかかわらず、もはや 両方

：

) トピックごとに閲覧: 4つのネットサイトのあるレベルでCOVID-19のN遺伝子を調べる

バリアントごとの閲覧: 3 つの COVID-19 バリアントを 1 つにまとめて精査する.

この形で微細でありながら、無限のピクルスのように感じるかもしれません、ユーザーが複数のチャートを作成してグリッドに追加できるようにすることで、より多くのレートを提供できる立場にありました. したがって、上記の例に従って、アラメダ郡の各下水道のファイルを精査したい場合は、各スペースを取り出して をクリックします。 Grid

に設置してこんなグリッドを作りますこれです：

A

グラフのグリッド カリフォルニア州アラメダ郡の 4 つの下水道での COVID-19 検出の比較

このようにグリッドを作成しても、これ、そしてURLはそのままです簡単に再現できるように変更を加えるアクションまたはブックマーク。 全体として、私たちはこの妥協に大喜びしており、すべての要素を 1 つのチャートに詰め込むよりも読みやすいと感じています.

チャート ビルダーと比較モードと同じくらい効果的です。 、場所の手順を使用して閉鎖された下水道の報告を取得するための1つの計画を追加しました。 私たちは、この手順を次の 2 つの理由から構成することを望んでいました:

私たちのほとんどは下水処理場の名前を知らないので、ほとんどの場合、テキストの誓いの資料で場所を購入するかもしれません

最終的なパブリックを指導する可能性があります。 「下水処理場」(下水処理場に流れ込む空間) の理論には反応しません。下水道処理場の地図を見ることは、それらについて学ぶための直感的な計画です.

参加するすべての廃水処理植物の手順.

スペースを拡大すると、 これらの植生のために下水道に転がり、手元に置いておきます：

Bay Notify と Sacramento を拡大して見た下水域の一部。

そして最後に、手順で近所を取り出しているときでも、すべてのスペースのインスタントサマリーをネットで確認できます。そのスペースで報告するこの時点での病原体:

サンフランシスコ南東部の概要を精査します。

このツールを起動して、添付した作業を分割して、このファイルの直感的な視覚化を作成することに腹を立てています。 今後のイテレーションでは、これを拡張したいと考えています。

カリフォルニア州の一般的な場所の COVID-19 の折れ線グラフを精査するときに、1 本の線を追加したいとします。これは、COVID-19 の州全体の実践を表しています。 採取された最終サンプルと比較して、測定された病原体の量を明らかにする最近の視覚化をいくつか追加したいと思います。 この手順では、特徴を表示して、どの病原体が脇に置いて全国的に大まかに流行しているかについての理論をユーザーに提供したいと考えています. WastewaterSCAN チームの研究者や利害関係者と協力して、科学的に正しく、ユーザーにとって直感的なオプションでこのツールを強化するために、精査を続けています。

自分の目で確かめてみてください–参加している廃水処理植物はありますか? だとしたら、そこで精査されている特性はどうですか？

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